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【昊工具】A基因的DNA甲基化和B疾病到底相不相關?記得查查這2個數據庫!

發稿時間:2021-02-26來源:AG娱乐APP生物

1)腫瘤TCGA數據庫數據(33種腫瘤類型的450K芯片數據,11種腫瘤類型的27K芯片數據)

2)NCBI GEO數據庫數據(51種疾病類型的450K,27KRRBS測序數據)

3)其他類型數據 (來源於文獻、其他數據的相關甲基化數據)

1)GeneSearch:查詢基因名稱或者基因組區域,獲得這個基因或者區域在存在組間差異的疾病類型樣本中的甲基化差異分析結果(均值,P值和圖示)
如:搜索DEFB119基因結果展示存在組間甲基化差異的疾病類型列表:

點擊具體疾病類型中的+Show按鈕,可獲得該基因所有探針在本疾病類型樣本中的差異熱圖:

2)DiseaseSearch:直接選定疾病類型,搜索基因的甲基化差異分析結果

3)AdvanceSearch:直接選定疾病類型、甲基化檢測平台,搜索基因的甲基化差異分析結果

4)更進階的分析功能:可選擇多個疾病,多個基因,除了常規的差異甲基化分析,還有生存分析,基因之間的相關性分析,疾病之間的相關性分析等

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